EnzymAgglo - Multiskalige modellgestützte Untersuchungen der Formation von katalytisch aktiven Clustern und Agglomeraten großer Multienymkomplexe

Auf der Ebene der voll zusammengesetzten aktiven PDC-Enzymkomplexe, d.h. bei einer Masse von ca. 9 MDa und einem Durchmesser von ca. 40 nm, existiert eine Vielfalt an Kombinationsmöglichkeiten und hohe Dynamik, so dass die komplette Struktur von PDC bisher nur abgeschätzt werden kann. Der Einfluss von Umgebungsparametern wie Temperatur und pH ist bisher ansatzweise belegt, jedoch nicht systematisch und strukturbasiert untersucht und verstanden, ebenso wenig wie von mechanischem Stress, z. B. Scherstress. Die korrekte Zusammensetzung der Komplexe ist jedoch essentiell für deren Aktivität und Effizienz. Darüber hinaus gibt es Anzeichen der Ausbildung von noch größerskaligen funktionalen und dynamischen Komplex-Clustern, wie möglicherweise auch von PDC in vivo in Mitochondrien von Säugerzellen. Durch DEM-Simulationen sollen Zusammensetzung von einzelnen PDC und PDC-Agglomeraten aufgeklärt werden.